本院兒童心臟科是中台灣地區先天性心臟病開心手術的重鎮，也是中部唯一執行複雜性先天性心臟病手術的醫學中心。
我們提供介入性（治療性）心導管術，包括氣球導管術、螺旋彈簧絲圈栓塞術、支架血管撐開術、心房中隔缺損閉合術、高頻波肺動脈閉鎖燒穿術、心臟電氣生理學及不整脈燒灼術、心房中隔缺損修補等治療，都有不錯的成績。
未來展望 提供最優質的醫療：結合各科專業，照顧重症病童，本院照顧的疾病嚴重度愈來愈高，高難度的醫療需要難度的醫療需要各科協助，除了兒科部各次專科的整形外， 更和小兒外科，心臟外科，病理科，放射科，放射腫瘤科，營養科等共同討論，提供專業的整體照顧。
小兒心臟科也加強與國內外醫學中心的小兒心臟科、心臟外科交流研究，全面提升診治幼兒心臟病的醫療，強化小兒加護病房團隊照護開心手術前後病童及小兒急重症的水準，使病童得到最佳治療成效。
重視醫學倫理：提供全家、全人的身心靈照護，醫療不止是科學上，身體上的治療，更要有倫理觀念和心靈照護，加強醫師們對醫學倫理的重視和實踐。
成人先天性心臟病特別門診，不限年齡皆提供看診服務。
